代码安装程序与APK安装程序的不同之处

将某程序apk放到android源码的apk文件夹中，然后编译代码烧到板子上，程序apk会自动安装，可是运行时会出现进程错误
如果将这个程序apk放到SD卡中然后用apk安装器进行安装，却可以正常运行。
请问这两种安装方式有什么区别？为什么同一个程序的不同安装方法会导致程序运行的不同？