建议你去看看 Sun 的 PetShop, 其中有用基于 WebStart 技术的 Swing+EJB 应用的例子, 对你应该很合适.
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至于安全,如果你选用好的APP SERVER,那么应该已经有了符合J2EE安全规范
的系统级服务。你的安全编程工作不会太难。至于‘无法逐个去客户端安装配置调试(客户在全国各地)’,打包分发就是啦!