浏览器打开linux应用程序

linux系统下的应用程序执行文件不是.exe格式的，我现在相通过浏览器启动linux下的应用程序，需要怎么执行，直接在脚本里加入链接到执行路径打开后是显示linux应用程序的执行脚本，不执行。如果修改webkit的内核源码，加入脚本的执行代码应该如何操作？？？？？？？什么安全性问题我都知道，现在就想使他执行。