要用 ISAPI 模块方式，按如下方法进行：
如果不想用 PHP 进行 HTTP 认证，应该跳过这一步。在“ISAPI 筛选器”标签页中添加一个新的 ISAPI 筛选器。“筛选器名称”设为 PHP，“可执行文件”设为 php4isapi.dll/php5isapi.dll 的路径。 选择“主目录”，“虚拟目录”或“目录”标签页，然后进行： 将执行权限改为“纯脚本” 点“配置”按钮，选择“映射”标签页。点击“添加”按钮，将“可执行文件”指向适当的 ISAPI DLL。例如 PHP 5 的值可能是：C:\php\php5isapi.dll。在“扩展名”中填入 .php。选择“全部动作”（或者“限制为”留空），选中“脚本引擎”。然后点击“确定”。 完全停止 IIS（NET STOP iisadmin） 重新启动 IIS（NET START w3svc）
对于 IIS 6（2003 Server），打开 IIS 管理器，进入 web 服务扩展，点击“添加一个新的 web 服务扩展”，“扩展名”中输入名称，例如 PHP，再点击“添加”按钮，点击“浏览”选择要么 ISAPI 文件（php4isapi.dll 或 php5isapi.dll）或者 CGI 文件（php.exe 或 php-cgi.exe）作为“文件路径”后点“确定”，然后选中“设置扩展状态为允许”并点“确定”。 要使用 index.php 作为默认文档，在“文档”标签页中选择“添加”。输入 index.php 并点“确定”。用上下箭头按钮调整顺序。这和在 Apache 中设定 DirectoryIndex 相似。 对于每个要关联为 PHP 脚本的后缀都要重复以上步骤。.php 是最常用的，此外为兼容一些遗留下来的老程序可能还需要加上 .php3。 如果过些时候之后碰到 CPU 占用率达到 100%，则取消选中“缓存 ISAPI 应用程序”（“主目录”下点“配置”按钮”）。
如果不想用 PHP 进行 HTTP 认证，应该跳过这一步。在“ISAPI 筛选器”标签页中添加一个新的 ISAPI 筛选器。“筛选器名称”设为 PHP，“可执行文件”设为 php4isapi.dll/php5isapi.dll 的路径。 选择“主目录”，“虚拟目录”或“目录”标签页，然后进行： 将执行权限改为“纯脚本” 点“配置”按钮，选择“映射”标签页。点击“添加”按钮，将“可执行文件”指向适当的 ISAPI DLL。例如 PHP 5 的值可能是：C:\php\php5isapi.dll。在“扩展名”中填入 .php。选择“全部动作”（或者“限制为”留空），选中“脚本引擎”。然后点击“确定”。 完全停止 IIS（NET STOP iisadmin） 重新启动 IIS（NET START w3svc）
对于 IIS 6（2003 Server），打开 IIS 管理器，进入 web 服务扩展，点击“添加一个新的 web 服务扩展”，“扩展名”中输入名称，例如 PHP，再点击“添加”按钮，点击“浏览”选择要么 ISAPI 文件（php4isapi.dll 或 php5isapi.dll）或者 CGI 文件（php.exe 或 php-cgi.exe）作为“文件路径”后点“确定”，然后选中“设置扩展状态为允许”并点“确定”。 要使用 index.php 作为默认文档，在“文档”标签页中选择“添加”。输入 index.php 并点“确定”。用上下箭头按钮调整顺序。这和在 Apache 中设定 DirectoryIndex 相似。 对于每个要关联为 PHP 脚本的后缀都要重复以上步骤。.php 是最常用的，此外为兼容一些遗留下来的老程序可能还需要加上 .php3。 如果过些时候之后碰到 CPU 占用率达到 100%，则取消选中“缓存 ISAPI 应用程序”（“主目录”下点“配置”按钮”）。
$d = dir("./");
while($f = $d->read())
{
echo $f."<br/>";
}运行结果：
.
..
ADROT.dll
adsiis.dll
ASP Compiled Templates
asp.dll
asp.mfl
asp.mof
browscap.dll
browscap.ini
CertMap.ocx
certobj.dll
CertWiz.ocx
clusftp.vbs
clusweb.vbs
Cnfgprts.ocx
coadmin.dll
ContRot.dll
....
奇怪极了，用CGI形式运行不会有此问题