关于程序打包发布的问题

以前我写程序都是自己单位用，随用随改，而且我写程序喜欢自己写不喜欢用工具，页面的东西都写到一起，html和script在一起，script 写在前面。现在给别的单位做个程序我是不是只有把页面东西分离，分成aspx和aspx.cs，然后编译成dll文件才可以呀？还有别的办法吗？只要用户看不到源文件script部分就行。