web.config文件的疑问

Question

我刚开始接触ASP.NET，用的是VS2008。现在有个问题感到困惑，我新建了一个网站，目录是d:\jiamei2008，在这个目录下有一个web.config文件。我在IIS里建立了虚拟目录，并进行配置，将配置文件也设置成了d:\jiamei2008\web.config，但是我在IIS的编辑配置里对身份验证修改后，d:\jiamei2008\web.config文件<system.web>节没有出现
        <authentication mode="Forms" />
        <roleManager enabled="true" />
        <authorization>
            <allow users="*"/>
        </authorization>
等内容，倒是C:\Windows\Microsoft.Net\Framework\v2.x\Config\web.config中有了以上内容，这是怎么回事？