如何在后台的方法中调用前台的JS函数

Question

事先声明一下，基本的方法我知道，但在运用的过程中，我发现了这么一种情况：
我在一个按钮的点击事件立即调用JS函数没有问题，但是当我的这个事件运行了
大量的运算，大概用了20秒的时间，我再在这个运算后调用JS函数，好像就不起作用了。       public void MyFunction()
        {
            if (this.hfQuestionNo.Value == "1")
            {
                this.hfQuestionNo.Value = "2";                ScriptManager.RegisterStartupScript(this, this.GetType(), "JSFunction", "DeleteRecord('" + FormatMessage("当前电脑的时间是: " + DateTime.Now.ToShortDateString() + " " + DateTime.Now.ToShortTimeString() + ", 是否正确 ?") + "');", true);
            }
            else if (this.hfQuestionNo.Value == "2")
            {
                this.hfQuestionNo.Value = "3";                if (this.hfConfirmTime.Value == "1")
                {
                    ScriptManager.RegisterStartupScript(this, this.GetType(), "JSFunction", "ShowWaiting();", true);
                }
            }
            else
            {
                this.hfQuestionNo.Value = "1";                if (this.hfConfirmTime.Value == "1")
                {
                    MyFunction2("1");                    ScriptManager.RegisterStartupScript(this, this.GetType(), "JSFunction", "HideWaiting();", true);                    Response.Write("<script type='text/javascript'>function HideWaiting(){}</script>");                    ClientScript.RegisterStartupScript(ClientScript.GetType(), "myscript", "<script>HideWaiting();</script>");                }
            }
        }
在以上的代码中，调用前台的JS函数的语句：
                ScriptManager.RegisterStartupScript(this, this.GetType(), "JSFunction", "DeleteRecord('" + FormatMessage("当前电脑的时间是: " + DateTime.Now.ToShortDateString() + " " + DateTime.Now.ToShortTimeString() + ", 是否正确 ?") + "');", true);和                    ScriptManager.RegisterStartupScript(this, this.GetType(), "JSFunction", "ShowWaiting();", true);都执行了，但是最后的几个没执行：
                    ScriptManager.RegisterStartupScript(this, this.GetType(), "JSFunction", "HideWaiting();", true);                    Response.Write("<script type='text/javascript'>function HideWaiting(){}</script>");                    ClientScript.RegisterStartupScript(ClientScript.GetType(), "myscript", "<script>HideWaiting();</script>");其中MyFunction2("1");有大量运算的。其实我的想法是，在用户确认了操作后，因为要用较长的时间生成一个文件，所以在页面上显示一个等待的图片和提示，这都没有问题。问题是，文件产生完毕后，下载到了本机后，我想把等待的信息和图片隐藏掉，就写了一个JS函数去实现，但这时好像一直没有执行这个函数，尽管我用了各种方法。请告诉指点一下。