asp.net修改后的DLL文件能放到原来的网站中使用吗？

我买了一套系统想对它的功能做一些修改但是他的CS文件都封装到DLL文件里面了，我用REFLECTOR导出CS文件文件后，做了一些修改，然后又用VS2003打包成了DLL文件，但是我听说，反编译后的CS文件并不是完全能反编译的，原来的系统是基于.net1.1构架的，还没有使用部分类，请各位高手帮帮忙提提意见，我虽然是贫农但分不会小气的。