动态加载程序集时如何正确处理引用？

应用程序A引用了F程序集，并且A与F处于同一目录下。此时A在运行时，动态加载B程序集（位于另外一个文件夹中），程序集B同样引用了F程序集（F程序集在B程序集的文件夹中存在一个副本）。这个时候，B程序集中的方法所获取的F程序集中的类型与A程序集中方法所获取的F程序集中同一类型实际上是不一样的，该如何解决这个问题？