关于用代码启动应用程序的奇怪问题

我写了一个服务，用于定期的启动某一个应用程序提示用户完成操作。但是发现用服务无法正常启动该应用程序，现像是该应用程序的进程在任务管理器里能找到，但是确无法正常的显示。也就是说在用户桌面上完全看不到该应用程序。我原以为是应用程序本身的问题，可是我又写了另一个测试程序，偿试启动该应用程序，发现成功了。为什么会出现这种通过系统服务无法启动程序，用普通程序却可以的情况？