File file1=new File("output.out");
BufferedWriter writer= new BufferedWriter(new FileWriter(file1));
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for(i=0;i<nl.getLength();i++){ 
    writer.write((doc.getElementsByTagName("input").item(i).getFirstChild().getNodeValue())); 
    writer.newLine();
    writer.write((doc.getElementsByTagName("output").item(i).getFirstChild().getNodeValue())); 

………………
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执行后output.out文件中什么东西都没有
并且这个writer貌似没有close()……?
writer.后的列表中只有Class<java.io.writer>这一个可选