java混淆器

用jocky的Eclipse插件来做混淆。。按网上操作什么都可以。也就是可以把里面的.java文件全都编译导到指定的目录。。现在问题是。怎么样把他放到项目里去！！！！。。我的项目是部署在linux服务器上。。是war包的形式。。求指点。。成功后马上给分