救助，javaweb应用怎么与吉大正元结合？

如题，目前我们开发了一个BS应用，应用程序服务器使用的是Tomcat7，客户已经建设了CA认证系统，使用的吉大正元的CA系统。
他们将为每个用户颁发一个USB key来作为登陆系统的凭证。
现在客户要求在我们的应用中加入CA认证。
由于我对CA一无所知，不知道在我们的应用中是否还需要进行代码开发以适合CA？
望各位高手详解如何在我们的应用中加入该CA认证系统？