请问应该把tomcat的启动文件startup.bat文件放到win.ini中的什么位置？

我做了一个项目，并放到服务器上。现在把tomcat的启动文件startuup.bat文件放到服务器的“开始”——“所有程序”——“启动”中启动，结果却非要我远程登录了服务器之后，输入密码，才能启动这个.bat文件。而其他的放在win.ini和system.ini中的文件，都已经全部启动了。 
于是就放到的autoexec.bat文件中，让它随着机器的启动而启动（系统是Windows server 2003），结果发现这个.bat文件居然没有启动，这是什么原因呢？ 
于是只好放到win.ini里面启动。但却找不到以前的那些小节的名称了。请问应该加到那个小节里面呢？
还有，是不是可以放在boot.ini和注册表文件里面启动的？应该怎么搞呢？可能会有网友说，服务器启动了就不要关，不就行了？但因为公司从开源节流和节约环保的观念出发，下班就关服务器的。所以只能想办法来解决startup.bat启动的问题了。
谢谢！