有关 Swing多线程

    小弟现碰到一问题，感觉不知道怎么搞，请教各位。
    我的程序是Swing的gui，界面上只有两个控件：JTextField和JButton，当程序一启动时，就另起一个线程在每隔50ms加1，把数值写到JTextField里，每当我点击JButton时，就又另起一个线程，这个线程的任务是用jni调用一个dll中的 jni_fun()，jni_fun()的内容是用SendMessage向一个CDialog发送一个消息，该消息处理函数是弹出一个 AfxMessageBox。
    问题来了，每当AfxMessageBox弹出后,我的Swing 界面停止了刷新，就是那个JTextField里的数值不再增加了，可是后台的那个每隔50ms加1的线程应该还在运行，原因是当我把 AfxMessageBox关闭后，那个JTextField又开始刷新了，从值的变化上看在没有刷新的那段时间内其值还是继续在增加着。
    我的疑惑是我在调用jni_fun()时是另起一个线程啊，为什么还会影响到我的界面刷新呢？