问一个Java和Perl之间的问题

Question

你这个思路是错误的，不可能实现。首先getInputStream()只能获得Perl解释器的输入流，Perl打印应该输出到输出流，所以只能使用getOutputStream()，但输出流没有办法读。此路不通。
换一个思路，命令行下，通常都提供管道功能（通过|连接），所以可以使用命令行所提供的管道，Java程序中，只需要从System.in中读取流就行了。下面是一个简单的测试例子：
// ProcessInput
// import Java packages
import java.io.*;
public class ProcessInput {
    public static void main( String[] args ) throws Exception {
        Reader in = new InputStreamReader( System.in );
        BufferedReader bin = new BufferedReader( in );
        String s = bin.readLine();
        int counter = 0;
        while( s != null ) {
            System.out.println( ++counter + ": " + s );
            s = bin.readLine();
        }
    }
}
命令行下命令为
HelloWorld.exe | java ProcessInput
HelloWorld.exe打印出十个"Hello, World!",输出为
1: Hello, World!
2: Hello, World!
3: Hello, World!
4: Hello, World!
5: Hello, World!
6: Hello, World!
7: Hello, World!
8: Hello, World!
9: Hello, World!
10: Hello, World!

Answer 1

谢谢你的热心解答，不过我忘了说清楚我的意思了。
其实我是想由那个Java文件来调用运行那个Perl文件，通过这个Java文件将Perl的输出再打印到屏幕上。但是类似于HelloWorld.exe | java ProcessInput这样的好像还是要手动运行那个Perl文件。

Answer 2

好像是我弄错了，这个是可以的，getInputStream()是将子进程的outputStream通过管道输出。
你这里错误的原因是你的Perl程序应该通过shell启动，而不是自己启动，可以定义一个字串如下：
String[] cmd = { "sh", "-c", dir + " " + task }; 

Answer 3

因为perl文件本身不是应用程序，所以要通过shell(sh)来解释
linux下可以查看sh的manpage，输入man sh即可
-c 指示sh读取后面的命令
dir + " " + task 就是你要执行的命令了

Answer 4

今天我发现其实是我这里在处理要返回的字符串上有一些问题，直接用exec(dir+" "+task)或者exec("perl "+dir+" "+task)都是可以的。但是我试着用exec("sh -c "+dir+" "+task)似乎task所表示的参数并没有起作用。
而在Console下直接运行sh -c ./free_align.pl aattagcaatagcat ccagttatc（free_align.pl对应于dir，aattagcaatagcat ccagttatc对应于task）也是参数没有起作用。但在Console下直接./free_align.pl aattagcaatagcat ccagttatc或者perl ./free_align.pl aattagcaatagcat ccagttatc都是可以的。