问一个关于序列化的问题？

最近写一个程序要用到深层拷贝就使用了序列化，程序可以正常运行，没有任何问题，但是有个问题我一直搞不懂，就是序列化是将对象写到磁盘上，而我这个程序是个循环的逻辑，需要不停的序列化，然后读出来。这个会不会把磁盘或者内存给搞爆啊。而且我这个程序每各几天就会把tomcat搞挂一次，但是检测内存没有溢出，不知道是不是跟序列化有关，
鉴于程序太大，具体代码就不粘贴了，大家有谁对序列化很熟悉的么？