关于sqlite3加密解密在java中的使用问题

我们公司在做一款基于java的windows桌面应用，用到了sqlite数据库，为了保证数据安全，需要加密。找了很多关于sqlite3加密解密的资料，都是实现源码加密解密接口，水平有限我直接下载了wxsqlite3，它已经实现了加密解密，我直接用它的shell在命令行里对数据库进行加密解密，可以达到我想要的效果。但是我们的软件是用hibernate连接数据库的，这样一来我就不知道如何将wxsqlite3和我的软件结合到一起了，如果直接用hibernate连接已经加密的数据库文件的话，会报错（file is encrypted or is not a database），我该如何用已经实现解密功能的wxsqlite3通过hibernate连接数据库呢。重写hibernate的连接数据库方法？调用dll里的方法？求大神解救sqlite3数据库加密解密