请问java程序在eclipse中运行怎么比cmd中慢

各位大侠  我做了一个俄罗斯方块 原理是用paint不断重画小方格 
我编译后直接java class 画面很流畅 没什么 
但在eclipse中运行或者打包java后会屏幕反而很变的一闪一闪那样 好像是刷新很慢 
这是为什么呢 
是class文件比jar快？ 
还是？？？？ 
这个有方法解决或者弥补吗？