关于 java程序打包成exe文件

我是个netbeans初学者，最近在网上下载一个系统，是关于银行管理的 
系统估计是用netbeans之类的架构的软件吧。。具体我也不知道，最外面还有一个打包好的执行程序   exe的。。 
我现在遇到的问题是，我把src里的文件调出来修改，然后从新放进去之后，想让程序按我修改的运行 
但是怎么修改那个执行程序呢是删掉   自己另外从新打包呢还是其他什么办法 
那个执行程序名字是   atmw.exe     同路径下还有一些文件   atm.html     atm.jar   atm.jar~   atm.jpx   atm.jpx.local   atm.jpx.local~   atm.jpx~   还有其他的bak文件夹       classes文件夹     data文件夹     image文件夹     src文件夹 请诸位大侠帮帮忙！！