改成这样就好了
<html>
<head>
<title>計時器</title>
<script language="javascript">
<!--
var CallTimeLen = "0";
timer1 = null;function DoCallTimer()
{  
  var minute="0";
     var second="0";
  CallTimeLen = parseInt(CallTimeLen)+1;
  minute = parseInt(CallTimeLen/60);
  second = CallTimeLen%60;
  if(minute=="0")
  {
   document.frmtimer.thzt.innerText ="您已用時:"+second+"秒";
 
  }
  else
  {
   document.frmtimer.thzt.innerText ="您已用時:"+minute+"分"+second+"秒";
 
  }
  timer1 = window.setTimeout("DoCallTimer()",1000);
} 
function stop1()
{
 clearTimeout(window.timer1);
}
-->
</script>
</head>
<body>
<form name="frmtimer" action="" method="post">
<hr>
<input type="text" name="thzt" id="thzt">
<br/><input type="button" value="開始計時" name="start" onClick="DoCallTimer()">
<input type="button" value="停止" name="stop" onClick="clearTimeout(timer1);"> //就是這個函數,把它改成下面的句話就不能調用
<input type="button" value="停止" name="stop" onClick="stop1()">//<hr>
</form></body>
</html>