JavaScript无法在浏览器上正常显示（由于毕业设计，非常急）

小弟现在做了一个BBS论坛项目，但是在做到后台时，在后台左侧导航栏使用JavaScript做了一个下拉式的菜单，做网页时使用的是Dreamwear ，但是通过Dreamwear调试网页，一起都显示正常,但是当我将项目拷贝到Myeclipse时，附加Tomcat后在浏览器浏览，左侧的菜单栏JS效果完全无法显示。文件时从网上拷贝的模板，而且通过Dreamwear调试可以正常显示，我想应该不是代码问题，但是找了半天不知道问题出在哪。 还望各位大哥可以定力相助，小弟在做毕业设计，非常急，下面是JS文件在HTML中的导入顺序，还有部分JS文件的代码：<script src="../js/prototype.lite.js" type="text/javascript"></script> 
<script src="../js/moo.fx.js" type="text/javascript"></script> 
<script src="../js/moo.fx.pack.js" type="text/javascript"></script>
prototype.lite.js中的代码：var Class = {
create: function() {
return function() {
this.initialize.apply(this, arguments);
}
}
}Object.extend = function(destination, source) {
for (property in source) destination[property] = source[property];
return destination;
}Function.prototype.bind = function(object) {
var __method = this;
return function() {
return __method.apply(object, arguments);
}
}Function.prototype.bindAsEventListener = function(object) {
var __method = this;
return function(event) {
__method.call(object, event || window.event);
}
}function $() {
if (arguments.length == 1) return get$(arguments[0]);
var elements = [];
$c(arguments).each(function(el){
elements.push(get$(el));
});
return elements; function get$(el){
if (typeof el == 'string') el = document.getElementById(el);
return el;
}
}if (!window.Element) var Element = new Object();Object.extend(Element, {
remove: function(element) {
element = $(element);
element.parentNode.removeChild(element);
}, hasClassName: function(element, className) {
element = $(element);
if (!element) return;
var hasClass = false;
element.className.split(' ').each(function(cn){
if (cn == className) hasClass = true;
});
return hasClass;
}, addClassName: function(element, className) {
element = $(element);
Element.removeClassName(element, className);
element.className += ' ' + className;
},
  
removeClassName: function(element, className) {
element = $(element);
if (!element) return;
var newClassName = '';
element.className.split(' ').each(function(cn, i){
if (cn != className){
if (i > 0) newClassName += ' ';
newClassName += cn;
}
});
element.className = newClassName;
}, cleanWhitespace: function(element) {
element = $(element);
$c(element.childNodes).each(function(node){
if (node.nodeType == 3 && !/\S/.test(node.nodeValue)) Element.remove(node);
});
}, find: function(element, what) {
element = $(element)[what];
while (element.nodeType != 1) element = element[what];
return element;
}
});var Position = {
cumulativeOffset: function(element) {
var valueT = 0, valueL = 0;
do {
valueT += element.offsetTop  || 0;
valueL += element.offsetLeft || 0;
element = element.offsetParent;
} while (element);
return [valueL, valueT];
}
};document.getElementsByClassName = function(className) {
var children = document.getElementsByTagName('*') || document.all;
var elements = [];
$c(children).each(function(child){
if (Element.hasClassName(child, className)) elements.push(child);
});  
return elements;
}//useful array functions
Array.prototype.iterate = function(func){
for(var i=0;i<this.length;i++) func(this[i], i);
}
if (!Array.prototype.each) Array.prototype.each = Array.prototype.iterate;function $c(array){
var nArray = [];
for (var i=0;i<array.length;i++) nArray.push(array[i]);
return nArray;
}moo.fx.js中代码：
var fx = new Object();
//base
fx.Base = function(){
};
fx.Base.prototype = {
setOptions: function(options) {
this.options = {
duration: 500,
onComplete: '',
transition: fx.sinoidal
}
Object.extend(this.options, options || {});
}, step: function() {
var time  = (new Date).getTime();
if (time >= this.options.duration+this.startTime) {
this.now = this.to;
clearInterval (this.timer);
this.timer = null;
if (this.options.onComplete) setTimeout(this.options.onComplete.bind(this), 10);
}
else {
var Tpos = (time - this.startTime) / (this.options.duration);
this.now = this.options.transition(Tpos) * (this.to-this.from) + this.from;
}
this.increase();
}, custom: function(from, to) {
if (this.timer != null) return;
this.from = from;
this.to = to;
this.startTime = (new Date).getTime();
this.timer = setInterval (this.step.bind(this), 13);
}, hide: function() {
this.now = 0;
this.increase();
}, clearTimer: function() {
clearInterval(this.timer);
this.timer = null;
}
}//stretchers
fx.Layout = Class.create();
fx.Layout.prototype = Object.extend(new fx.Base(), {
initialize: function(el, options) {
this.el = $(el);
this.el.style.overflow = "hidden";
this.iniWidth = this.el.offsetWidth;
this.iniHeight = this.el.offsetHeight;
this.setOptions(options);
}
});fx.Height = Class.create();
Object.extend(Object.extend(fx.Height.prototype, fx.Layout.prototype), {
increase: function() {
this.el.style.height = this.now + "px";
}, toggle: function() {
if (this.el.offsetHeight > 0) this.custom(this.el.offsetHeight, 0);
else this.custom(0, this.el.scrollHeight);
}
});fx.Width = Class.create();
Object.extend(Object.extend(fx.Width.prototype, fx.Layout.prototype), {
increase: function() {
this.el.style.width = this.now + "px";
}, toggle: function(){
if (this.el.offsetWidth > 0) this.custom(this.el.offsetWidth, 0);
else this.custom(0, this.iniWidth);
}
});//fader
fx.Opacity = Class.create();
fx.Opacity.prototype = Object.extend(new fx.Base(), {
initialize: function(el, options) {
this.el = $(el);
this.now = 1;
this.increase();
this.setOptions(options);
}, increase: function() {
if (this.now == 1 && (/Firefox/.test(navigator.userAgent))) this.now = 0.9999;
this.setOpacity(this.now);
},

setOpacity: function(opacity) {
if (opacity == 0 && this.el.style.visibility != "hidden") this.el.style.visibility = "hidden";
else if (this.el.style.visibility != "visible") this.el.style.visibility = "visible";
if (window.ActiveXObject) this.el.style.filter = "alpha(opacity=" + opacity*100 + ")";
this.el.style.opacity = opacity;
}, toggle: function() {
if (this.now > 0) this.custom(1, 0);
else this.custom(0, 1);
}
});//transitions
fx.sinoidal = function(pos){
return ((-Math.cos(pos*Math.PI)/2) + 0.5);
//this transition is from script.aculo.us
}
fx.linear = function(pos){
return pos;
}
fx.cubic = function(pos){
return Math.pow(pos, 3);
}
fx.circ = function(pos){
return Math.sqrt(pos);
}