据我所知,把你的.class文件保存在webapps\****\WEB-INF\classes 目录下, 其中的 **** 表示你自己做的目录,也可以用现在原有的目录,比如 “ROOT”。 不管保存在哪个目录下,那个目录的子目录必须要有\WEB-INF\classes 
需要注意的是,自己做的目录,要把 \Tomcat 4.1\conf目录下的server.xml用文本编译器进行修改, 填加自己做的目录,例子如下:
<!-- Sample Context -->
<Context path="/test" docBase="test" debug="0" reloadable="true"/>
其中“test”表示你自己新做的目录名;然后在“test”目录下,加入子目录\WEB-INF\classes