求购:J2EE项目如何实现加密

项目是用struts，spring实现的，现在需要对项目中class文件进行加密。
在网上查阅了相关资料，通过自定义classloader可以实现，自定义classloader装载加密的class文件，然后对其解密。现已实现对class文件加密，并通过自定义classloader解密。但现在问题是如何让自定义的classloader应用到J2EE项目中去。tomcat有自己默认的classloader，如何在不改变tomcat源码的情况下让自定义的classloader应用到J2EE项目中。