Java怎样生成双层PDF

如题，本人想实现制作双层PDF的功能，不知道有什么好方法没！另外我之前用JodConverter来转换PDF的，不知道他能不能生成双层PDF。
双层PDF生成系统是指将标准资料通过扫描仪快速录入后，经过去污、纠偏和OCR识别，然后可以直接生成可以检索的PDF文件，这个PDF文件是双层的，上层是原始图像，下层是识别结果，这样可以100%保留原始版面效果，并且支持选择/复制/检索等功能，这样的PDF文件最后可以存储在光盘、硬盘或磁盘阵列中，并通过建立索引数据库进行科学的管理。