关联表的删改，大家是怎么处理的？

分类、品牌、属性与商品，
商品与订单
区域与用户
……
像这样的表之间的关联关系错综复杂。
对它们进行删除和修改的时候就会出现很多问题,应该如何去处理呢？限制不要删除？一层层地用程序去判断？
大家在处理这些的时候都有些什么高招，还望不吝赐教！关联表 删改