自己想开发一个PHP web应用，底层不知道从何写起了，希望大家给点指点

想开发一个PHP web应用，不想使用框架，自己想从底层写起，提高下自己的编程水平，但是发现不知道从何写起。以前看过很多开源的程序，大部分是先写一个入口文件“index.php”然后再引入其他的文件，但是一到自己写的时候，不知道怎么写了，希望大家给点意见，先谢过了！