求大婶们指个明路

现在做个小程序 遇到个大问题。问题可以按照文件目录结构来理解，大意如下：
我从根目录开始读取，依次读取所有文件，并且构建树。
但是现在的情况下，读完根目录，紧接着就可能读取出第三层中的某个文件，跨过了第二层。
也就是说，会读取出某个文件，但这时还没有读取出这个文件的父目录，这个文件就成了孤立节点。每一项都有一个编号，和父目录的编号。
这种情况下如何构建树呢？