如何对文件进行保密

各位大侠，问题背景如下
我们开发的软件是基于某程序的，框架如下
                    特定类型文件
                        ||
                     \/
  ----------  COM           UART
   上层应用程序|---|中间层软件|－－－|硬件模块|
  -----------
  中间层和硬件模块是购买的，我们负责开发上层应用程序。
   目前的问题就是中间层软件必须打开其特定的文件，读取特定文件才可驱动硬件模块(类似word可以打开doc文件，必须在磁盘上，word可以采用OLE控制）。
   我们的上层应用程序与中间件通过COM的方式交互，可以通过COM发送命令让中间件打开其所需文件，此文件必须存储在磁盘上，且我们与中间件的文件相关交互命令只有打开、关闭、保存，注意无新建命令。
   现在的问题就是，中间层和硬件模块是从供应商处购买的，供应商也将此部分卖给了很多其它集成商，但中间件的软件所需文件却大家都可以打开。我们希望能够对此文件保密，但却不能破坏中间层软件打开文件的流程。
   各位大侠，有没有方法可以实现文件的保密？
   我初步的想法是，将特定类型文件加密打包到DLL中，上层应用程序调用DLL与中间层通信，中间层被调用时，DLL将文件释放出来，存储在硬盘上，通过DLL控制中间层打开特定文件，中间层调用结束后，读出文件的输出数据，但删除文件。
   这样做的缺点是，在中间层调用时，DLL释放出的文件还是可以被客户或者竞争对手搜索到。因为这种特定文件中除了数据以外，还有一些关键技术(此文件是可采用中间层操作设定特定工作流的)。   各位大侠，有没有更好的方法，可以做到即让中间层在被调用时可以打开所需文件，并对此文件操做，但同时此文件又不能被竞争对手或者客户看到？注意，中间层软件只能打开磁盘上的文件，应该是无法打开内存文件的。