CAD类软件系统中与用户的复杂交互如何轻松的维护

本人前一段时间联合挨踢界（IT）的几个朋友，联手开发了一套CAD类软件，该系统有中对我们来说非常头疼的是GUI与用户交互的时候的处理，非常的麻烦，以至于项目差点就搁浅了。
问题是这样的，该CAD软件有四个相应鼠标右键的视图，若干工具栏，一个类似VC的多功能属性对话框，菜单栏，还有相应鼠标右键的树形控制。用户的操作可以用不同的方式。并且操作很复杂，如何合理的维护好这个交互过程？请各位高手不吝赐教，谢谢！