求助，谁能帮我想一个方案！（关于跨平台的文件操作）

我在windows端想要控制一个unix服务器下的指定文本文件，在unix下的指定文件的末尾加东西。要怎么实现呢。
  我初步考虑了一下，这样做。每次先ftp我要修改的文件到我的windows端，在文件末尾添加完毕后再通过ftp传回到我的unix服务器上。
  但是我总觉得这样做不是很好，效率太低了。特别是当我的文件太大的时候。但是我想不出其他的办法了。希望大家给点意见。